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        全長轉錄組測序

        作者: 更新時間:2022-03-22 點擊數:

        全長轉錄組測序

        基于PacBio三代測序平臺的全長轉錄組測序,可直接獲取mRNA全長序列,更為準確地解讀mRNA結構信息,重點關注基因的可變剪切、融合基因等。


        測序應用領域

        獲得基因組未知物種的基因集,用于基因功能研究

        ◇ 基因結構差異分析

        ◇ 發現新轉錄本

        ◇ 分子機制研究

        ◇ 基因表達調控研究


        飛凡檢測測序的優勢:

        ◇ 完善的樣品提取檢測方案,保障 mRNA 的完整性;

        ◇飛凡檢測擁有 PacBio Sequel 及 PacBio RSII 單分子測序平臺,提供測序服務;

        ◇ 深度測序推薦,挖掘低豐度基因信息;

        ◇ 分析團隊,項目經驗豐富,提供個性化分析內容。


        技術路線:


        全長轉錄組測序原理2.png

        飛凡檢測關于全長轉錄組測序常見問題




        1. 1. PacBio測序平臺的技術原理?

          利用 PacBio RS II/Sequel 進行全長轉錄組測序,平臺包含 16 個測序模塊(SMRT cell),每個 SMRT cell 包含 15 萬/100萬個測序單元(零模波導孔,ZMWs)。需要將 mRNA 進行反轉錄并進行環化處理,形成 CCS,每個 ZMW(零模波導孔)將容納 1 個 CCS 分子。由于全長轉錄組測序對 mRNA 不進行打斷,直接進行上機測序,而每個 CCS 的片段長度不同,較小的 CCS 會先落入 ZMWs 中,而導致長片段很難測到。因此,在文庫構建時,需要將 mRNA 根據長度分成不同的段,分別構建文庫和測序。

        2. 2. PacBio測序平臺測序方案有什么推薦?

          對樣本進行分段處理,構建不同片段長度的文庫,我們推薦每個樣本構建3-6個文庫。 建議8-15G subreads。

        3. 3. 全長轉錄組測序分析內容包括哪些?

          分析內容包括:轉錄本覆蓋度計算、轉錄本功能注釋、轉錄本GO 分類注釋、轉錄本 eggNOG分類注釋、轉錄本KEGG分類注釋、ORF分析、可變剪接分析等。


        飛凡檢測質檢報告流程:


        1、 提供產品資料

        2、 工程師根據您的產品推薦合適檢測項目,并給出報價

        3、 確認報價沒有問題,然把樣品送到我們實驗室

        4、 支付檢測費用,安排檢測

        5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶

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        飛凡檢測致力于打造國內專業的第三方檢測服務公司,不斷優化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟大學,蘇州大學,SGS,TUV,以及國內眾多知名的檢測公司進行深度合作,共同為國內制造業服務,為中國的制造業開拓海外市場保駕護航,為我們日常生活的健康安全樹立標桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學歷;我們合作的實驗室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報告都有CNAS,CMA資質,確保出具的每份報告都具有權威的法律效力。


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