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        數字表達譜測序

        作者:小編 更新時間:2022-05-06 點擊數:

          表達譜是指通過構建處于某一特定狀態下的細胞或組織的非偏性cDNA文庫,大規模cDNA測序,收集cDNA序列片段、定性、定量分析其mRNA群體組成,從而描繪該特定細胞或組織在特定狀態下的基因表達種類和豐度信息。新一代高通量測序技術和高性能的生物信息分析實現了表達譜分析的數字化、高效性,能夠全面、快速地定量檢測物種特定組織或發育時期的基因表達種類和豐度信息。數字表達譜測序(DEG)已被廣泛應用于基礎科學研究、環境改造、醫學研究和藥物研發等領域。



        1. 質檢文件:樣本質檢報告和質控報告;

        2. 測序數據質量報告,包含所有測序序列的序列信息,去除原始數據中的低質量序列和接頭;

        3. 數據分布的隨機性分析;

        4. 功能注釋;

        5. 與參考序列比對,統計差異表達基因;

        6. 根據客戶的要求,比較不同處理間的差異表達基因;

        7. 對差異表達基因做GO分類圖、KEGG富集分析、基因表達模式聚類分析等;

        8. 蛋白互作網絡分析。



        1. 數字化信號:直接測定每個基因的特異表達標簽序列,通過計數表達標簽序列的數目來確定該基因的表達量,大大提高了定量分析的準確度;

        2. 可重復性高:不同批次的表達譜度量準確,能夠更準確的進行表達差異分析;

        3. 高靈敏度:對于表達存在差異的基因能夠靈敏的檢測其表達差異,能夠檢測出低豐度的表達基因;

        4. 高通量和高覆蓋度:一次測序可得到1千萬以上的mRNA標簽,一次測序即可鑒定樣本中所有轉錄本信息;

        5. 高準確性:使用RPKM方法計算基因表達量,消除基因長度和測序量差異對計算基因表達的影響確?;虮磉_量計算的高準確性。

        6. 測序讀長更長:優化建庫方案,增加測序讀長,使數據分析更準確。



        (一)樣品類型

          1. 總RNA:樣品濃度≥200 ng/μl,樣品總量≥10 μg;樣品純度: OD260/280為1.8~2.2,OD260/230≥1.0,260 nm處有正常峰值。RNA完整性: 電泳檢測28S/18S≥1.5。

          2. 組織:植物組織樣品取樣后用錫箔紙包裹并標注,立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中;動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注,立即液氮速凍,保存于液氮或超低溫冰箱中。請盡量使用新制備的樣品且樣品量至少滿足3次以上提?。ㄆ胀悠?.6 g以上,RNA含量少的花、果實等組織需要加量送);

         

        (二)樣本運輸

          1. 總RNA樣品請溶于RNase-free H2O或乙醇中,置于1.5 ml RNase-free離心管中,管上注明樣品名稱、濃度以及制備時間,管口使用Parafilm封口,干冰運輸;

          2. 植物組織、動物組織、細胞或菌體取樣后置于凍存管中并標注,使用足量的干冰運輸,并且盡量選用較快的郵遞方式,以降低運輸過程中樣品降解的可能性。


        飛凡檢測質檢報告流程:

        1、 提供產品資料

        2、 工程師根據您品資料的產品推薦合適檢測項目,并給出報價

        3、 確認報價沒有問題,然后把樣品送到我們實驗室

        4、 支付檢測費用,安排檢測

        5、檢測完成,出具檢測報告,郵寄給客戶

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        飛凡檢測致力于打造國內專業的第三方檢測服務公司,不斷優化整合市場檢測資源,飛凡檢測與多家科研院所,如上海同濟大學,蘇州大學,SGS,TUV,以及國內眾多知名的檢測公司進行深度合作,共同為國內制造業服務,為中國的制造業開拓海外市場保駕護航,為我們日常生活的健康安全樹立標桿;公司目前工程師百余人,95%以上是本科以上學歷;我們合作的實驗室通過CNAS,CMA(EZ),所出具的任何一張報告都有CNAS,CMA資質,確保出具的每份報告都具有權威的法律效力。



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