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        土壤微生物分析

        作者:小編 更新時間:2022-03-29 點擊數:

          土壤微生物種類繁多,包括細菌、真菌、放線菌以及各種藻類。它們在土壤中進行氧化、硝化、氨化、固氮、硫化等過程,促進土壤有機質的分解和養分的轉化,其種類和數量隨成土環境及其土層深度的不同而變化。土壤微生物一般以細菌數量最多,有益的細菌有固氮菌、硝化細菌和腐生細菌;有害的細菌有反硝化細菌等。


          基于16S/18S/ITS序列擴增,根據客戶需求采用不同測序平臺(Roche 454、 Illumina MiSeq和Ion Torrent PGM),利用NGS高通量測序技術,獲得龐大的數據信息,通過現代生物信息學手段,獲得微生物總體群落,并通過RDA,CCA,NMDS分析,找到環境因子(pH,C/N,濕度,總氮,總磷,TOC,含水量等)與微生物群落組成的相關性,進而分析微生物與環境的相互關系。

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        樣品采集及運送:

          新鮮樣品:土壤:3-5 g(干沙土、干粘土、農田土、堆肥、底泥、泥炭土、淤泥等)

          DNA樣品:濃度大于 10ng/uL,總量大于 500ng 的基因組 DNA,DNA 純度較差或降解嚴重會影響后繼的擴增實驗。如果方便的話,可提供電子版DNA電泳檢測照片及 OD260/280=1.8-2.0比值

          樣品運送:送樣時采用干冰保存運輸;若是距離較遠,建議采用干冰加冰袋,存放于冰盒中運送

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